Метод главных компонентов (английский - principal component analysis, PCA) упрощает сложность высокоразмерных данных, сохраняя тенденции и шаблоны. Он делает это, преобразуя данные в меньшие размеры, которые действуют, как резюме функций. Такие данные очень распространены в разных отраслях науки и техники, и возникают, когда для каждого образца измеряются несколько признаков, например, таких как экспрессия многих видов. Подобный тип данных представляет проблемы, вызванные повышенной частотой ошибок из-за множественной коррекции данных.

Метод похож на кластеризацию - находит шаблоны без ссылок и анализирует их, проверяя, взяты ли образцы из разных групп исследования, и имеют ли они существенные различия. Как и во всех статистических методах, его можно применить неправильно. Масштабирование переменных может привести к разным результатам анализа, и очень важно, чтобы оно не корректировалось, на предмет соответствия предыдущему значению данных.

Цели анализа компонентов

Основная цель метода - обнаружить и уменьшить размерность набора данных, определить новые значимые базовые переменные. Для этого предлагается использовать специальные инструменты, например, собрать многомерные данные в матрице данных TableOfReal, в которой строки связаны со случаями и столбцами переменных. Поэтому TableOfReal интерпретируется как векторы данных numberOfRows, каждый вектор которых имеет число элементов Columns.

Традиционно метод главных компонентов выполняется по ковариационной матрице или по корреляционной матрице, которые можно вычислить из матрицы данных. Ковариационная матрица содержит масштабированные суммы квадратов и кросс-произведений. Корреляционная матрица подобна ковариационной матрице, но в ней сначала переменные, то есть столбцы, были стандартизованы. Вначале придется стандартизировать данные, если дисперсии или единицы измерения переменных сильно отличаются. Чтобы выполнить анализ, выбирают матрицу данных TabelOfReal в списке объектов и даже нажимают перейти.

Это приведет к появлению нового объекта в списке объектов по методу главных компонент. Теперь можно составить график кривых собственных значений, чтобы получить представление о важности каждого. И также программа может предложить действие: получить долю дисперсии или проверить равенство числа собственных значений и получить их равенство. Поскольку компоненты получены путем решения конкретной задачи оптимизации, у них есть некоторые «встроенные» свойства, например, максимальная изменчивость. Кроме того, существует ряд других их свойств, которые могут обеспечить факторный анализ:

  • дисперсию каждого, при этом доля полной дисперсии исходных переменных задается собственными значениями;
  • вычисления оценки, которые иллюстрируют значение каждого компонента при наблюдении;
  • получение нагрузок, которые описывают корреляцию между каждым компонентом и каждой переменной;
  • корреляцию между исходными переменными, воспроизведенными с помощью р-компонента;
  • воспроизведения исходных данных могут быть воспроизведены с р-компонентов;
  • «поворот» компонентов, чтобы повысить их интерпретируемость.

Выбор количества точек хранения

Существует два способа выбрать необходимое количество компонентов для хранения. Оба метода основаны на отношениях между собственными значениями. Для этого рекомендуется построить график значений. Если точки на графике имеют тенденцию выравниваться и достаточно близки к нулю, то их можно игнорировать. Ограничивают количество компонентов до числа, на которое приходится определенная доля общей дисперсии. Например, если пользователя удовлетворяет 95% от общей дисперсии - получают количество компонентов (VAF) 0.95.

Основные компоненты получают проектированием многомерного статистического анализа метода главных компонентов datavectors на пространстве собственных векторов. Это можно сделать двумя способами - непосредственно из TableOfReal без предварительного формирования PCA объекта и затем можно отобразить конфигурацию или ее номера. Выбрать объект и TableOfReal вместе и «Конфигурация», таким образом, выполняется анализ в собственном окружении компонентов.

Если стартовая точка оказывается симметричной матрицей, например, ковариационной, сначала выполняют сокращение до формы, а затем алгоритм QL с неявными сдвигами. Если же наоборот и отправная точка является матрица данных, то нельзя формировать матрицу с суммами квадратов. Вместо этого, переходят от численно более стабильного способа, и образуют разложения по сингулярным значениям. Тогда матрица будет содержать собственные векторы, а квадратные диагональные элементы - собственные значения.

Основным компонентом является нормализованная линейная комбинация исходных предикторов в наборе данных по методу главных компонент для чайников. На изображении выше PC1 и PC2 являются основными компонентами. Допустим, есть ряд предикторов, как X1, X2...,Xp.

Основной компонент можно записать в виде: Z1 = 11X1 + 21X2 + 31X3 + .... + p1Xp

  • Z1 - является первым главным компонентом;
  • p1 - является вектором нагрузки, состоящим из нагрузок (1, 2.) первого основного компонента.

Нагрузки ограничены суммой квадрата равного 1. Это связано с тем, что большая величина нагрузок может привести к большой дисперсии. Он также определяет направление основной компоненты (Z1), по которой данные больше всего различаются. Это приводит к тому, что линия в пространстве р-мер, ближе всего к n-наблюдениям.

Близость измеряется с использованием среднеквадратичного евклидова расстояния. X1..Xp являются нормированными предикторами. Нормализованные предикторы имеют среднее значение, равное нулю, а стандартное отклонение равно единице. Следовательно, первый главный компонент - это линейная комбинация исходных предикторных переменных, которая фиксирует максимальную дисперсию в наборе данных. Он определяет направление наибольшей изменчивости в данных. Чем больше изменчивость, зафиксированная в первом компоненте, тем больше информация, полученная им. Ни один другой не может иметь изменчивость выше первого основного.

Первый основной компонент приводит к строке, которая ближе всего к данным и сводит к минимуму сумму квадрата расстояния между точкой данных и линией. Второй главный компонент (Z2) также представляет собой линейную комбинацию исходных предикторов, которая фиксирует оставшуюся дисперсию в наборе данных и некоррелирована Z1. Другими словами, корреляция между первым и вторым компонентами должна равняться нулю. Он может быть представлен как: Z2 = 12X1 + 22X2 + 32X3 + .... + p2Xp.

Если они некоррелированы, их направления должны быть ортогональными.

После того как вычислены главные компоненты начинают процесс прогнозирования тестовых данных с их использованием. Процесс метода главных компонент для чайников прост.

Например, необходимо сделать преобразование в тестовый набор, включая функцию центра и масштабирования в языке R (вер.3.4.2) и его библиотеке rvest. R - свободный язык программирования для статистических вычислений и графики. Он был реконструирован в 1992 году для решения статистических задач пользователями. Это полный процесс моделирования после извлечения PCA.

Для реализации PCA в python импортируют данные из библиотеки sklearn. Интерпретация остается такой же, как и пользователей R. Только набор данных, используемый для Python, представляет собой очищенную версию, в которой отсутствуют вмененные недостающие значения, а категориальные переменные преобразуются в числовые. Процесс моделирования остается таким же, как описано выше для пользователей R. Метод главных компонент, пример расчета:

Идея метода основного компонента заключается в приближении этого выражения для выполнения факторного анализа. Вместо суммирования от 1 до p теперь суммируются от 1 до m, игнорируя последние p-m членов в сумме и получая третье выражение. Можно переписать это, как показано в выражении, которое используется для определения матрицы факторных нагрузок L, что дает окончательное выражение в матричной нотации. Если используются стандартизованные измерения, заменяют S на матрицу корреляционной выборки R.

Это формирует матрицу L фактор-нагрузки в факторном анализе и сопровождается транспонированной L. Для оценки конкретных дисперсий фактор-модель для матрицы дисперсии-ковариации.

Теперь будет равна матрице дисперсии-ковариации минус LL " .

  • Xi - вектор наблюдений для i-го субъекта.
  • S обозначает нашу выборочную дисперсионно-ковариационную матрицу.

Тогда p собственные значения для этой матрицы ковариации дисперсии, а также соответствующих собственных векторов для этой матрицы.

Собственные значения S:λ^1, λ^2, ... , λ^п.

Собственные векторы S:е^1, e^2, ... , e^п.

Анализ PCA - это мощный и популярный метод многомерного анализа, который позволяет исследовать многомерные наборы данных с количественными переменными. По этой методике широко используется метод главных компонент в биоинформатике, маркетинге, социологии и многих других областях. XLSTAT предоставляет полную и гибкую функцию для изучения данных непосредственно в Excel и предлагает несколько стандартных и расширенных опций, которые позволят получить глубокое представление о пользовательских данных.

Можно запустить программу на необработанных данных или на матрицах различий, добавить дополнительные переменные или наблюдения, отфильтровать переменные в соответствии с различными критериями для оптимизации чтения карт. Кроме того, можно выполнять повороты. Легко настраивать корреляционный круг, график наблюдений в качестве стандартных диаграмм Excel. Достаточно перенести данные из отчета о результатах, чтобы использовать их в анализе.

XLSTAT предлагает несколько методов обработки данных, которые будут использоваться на входных данных до вычислений основного компонента:

  1. Pearson, классический PCA, который автоматически стандартизирует данные для вычислений, чтобы избежать раздутого влияния переменных с большими отклонениями от результата.
  2. Ковариация, которая работает с нестандартными отклонениями.
  3. Полихорические, для порядковых данных.

Примеры анализа данных размерностей

Можно рассмотреть метод главных компонентов на примере выполнения симметричной корреляционной или ковариационной матрицы. Это означает, что матрица должна быть числовой и иметь стандартизованные данные. Допустим, есть набор данных размерностью 300 (n) × 50 (p). Где n - представляет количество наблюдений, а p - число предикторов.

Поскольку имеется большой p = 50, может быть p(p-1)/2 диаграмма рассеяния. В этом случае было бы хорошим подходом выбрать подмножество предиктора p (p<< 50), который фиксирует количество информации. Затем следует составление графика наблюдения в полученном низкоразмерном пространстве. Не следует забывать, что каждое измерение является линейной комбинацией р-функций.

Пример для матрицы с двумя переменными. В этом примере метода главных компонентов создается набор данных с двумя переменными (большая длина и диагональная длина) с использованием искусственных данных Дэвиса.

Компоненты можно нарисовать на диаграмме рассеяния следующим образом.

Этот график иллюстрирует идею первого или главного компонента, обеспечивающего оптимальную сводку данных - никакая другая линия, нарисованная на таком графике рассеяния, не создаст набор прогнозируемых значений точек данных на линии с меньшей дисперсией.

Первый компонент также имеет приложение в регрессии с уменьшенной главной осью (RMA), в которой предполагается, что как x-, так и y-переменные имеют ошибки или неопределенности или, где нет четкого различия между предсказателем и ответом.

Метод главных компонентов в эконометрике - это анализ переменных, таких как ВНП, инфляция, обменные курсы и т. д. Их уравнения затем оцениваются по имеющимся данным, главным образом совокупным временным рядам. Однако эконометрические модели могут использоваться для многих приложений, а не для макроэкономических. Таким образом, эконометрика означает экономическое измерение.

Применение статистических методов к соответствующей эконометрике данных показывает взаимосвязь между экономическими переменными. Простой пример эконометрической модели. Предполагается, что ежемесячные расходы потребителей линейно зависят от доходов потребителей в предыдущем месяце. Тогда модель будет состоять из уравнения

Задачей эконометрика является получение оценок параметров a и b. Эти оценочные значения параметров, если они используются в уравнении модели, позволяют прогнозировать будущие значения потребления, которые будут зависеть от дохода предыдущего месяца. При разработке этих видов моделей необходимо учитывать несколько моментов:

  • характер вероятностного процесса, который генерирует данные;
  • уровень знаний об этом;
  • размер системы;
  • форма анализа;
  • горизонт прогноза;
  • математическая сложность системы.

Все эти предпосылки важны, потому что от них зависят источники ошибок, вытекающих из модели. Кроме того, для решения этих проблем необходимо определить метод прогнозирования. Его можно привести к линейной модели, даже если имеется только небольшая выборка. Этот тип является одним из самых общих, для которого можно создать прогнозный анализ.

Непараметрическая статистика

Метод главных компонент для непараметрических данных относится к методам измерения, в которых данные извлекаются из определенного распределения. Непараметрические статистические методы широко используются в различных типах исследований. На практике, когда предположение о нормальности измерений не выполняется, параметрические статистические методы могут приводить к вводящим в заблуждение результатам. Напротив, непараметрические методы делают гораздо менее строгие предположения о распределении по измерениям.

Они являются достоверными независимо от лежащих в их основе распределений наблюдений. Из-за этого привлекательного преимущества для анализа различных типов экспериментальных конструкций было разработано много разных типов непараметрических тестов. Такие проекты охватывают дизайн с одной выборкой, дизайн с двумя образцами, дизайн рандомизированных блоков. В настоящее время непараметрический байесовский подход с применением метода главных компонентов используется для упрощения анализа надежности железнодорожных систем.

Железнодорожная система представляет собой типичную крупномасштабную сложную систему с взаимосвязанными подсистемами, которые содержат многочисленные компоненты. Надежность системы сохраняется за счет соответствующих мер по техническому обслуживанию, а экономичное управление активами требует точной оценки надежности на самом низком уровне. Однако данные реальной надежности на уровне компонентов железнодорожной системы не всегда доступны на практике, не говоря уже о завершении. Распределение жизненных циклов компонентов от производителей часто скрывается и усложняется фактическим использованием и рабочей средой. Таким образом, анализ надежности требует подходящей методологии для оценки времени жизни компонента в условиях отсутствия данных об отказах.

Метод главных компонент в общественных науках используется для выполнения двух главных задач:

  • анализа по данным социологических исследований;
  • построения моделей общественных явлений.

Алгоритмы расчета моделей

Алгоритмы метода главных компонент дают другое представление о структуре модели и ее интерпретации. Они являются отражением того, как PCA используется в разных дисциплинах. Алгоритм нелинейного итеративного частичного наименьшего квадрата NIPALS представляет собой последовательный метод вычисления компонентов. Вычисление может быть прекращено досрочно, когда пользователь считает, что их достаточно. Большинство компьютерных пакетов имеют тенденцию использовать алгоритм NIPALS, поскольку он имеет два основных преимущества:

  • он обрабатывает отсутствующие данные;
  • последовательно вычисляет компоненты.

Цель рассмотрения этого алгоритма:

  • дает дополнительное представление о том, что означают нагрузки и оценки;
  • показывает, как каждый компонент не зависит ортогонально от других компонентов;
  • показывает, как алгоритм может обрабатывать недостающие данные.

Алгоритм последовательно извлекает каждый компонент, начиная с первого направления наибольшей дисперсии, а затем второго и т. д. NIPALS вычисляет один компонент за раз. Вычисленный первый эквивалентен t1t1, а также p1p1 векторов, которые были бы найдены из собственного значения или разложения по сингулярным значениям, может обрабатывать недостающие данные в XX. Он всегда сходится, но сходимость иногда может быть медленной. И также известен, как алгоритм мощности для вычисления собственных векторов и собственных значений и отлично работает для очень больших наборов данных. Google использовал этот алгоритм для ранних версий своей поисковой системы.

Алгоритм NIPALS показан на фото ниже.

Оценки коэффициента матрицы Т затем вычисляется как T=XW и в частичной мере коэффициентов регрессии квадратов B из Y на X, вычисляются, как B = WQ. Альтернативный метод оценки для частей регрессии частичных наименьших квадратов можно описать следующим образом.

Метод главных компонентов - это инструмент для определения основных осей дисперсии в наборе данных и позволяет легко исследовать ключевые переменные данных. Правильно примененный метод является одним из самых мощных в наборе инструментов анализа данных.

Компонентный анализ относится к многомерным методам снижения размерности. Он содержит один метод - метод главных компонент. Главные компоненты представляют собой ортогональную систему координат, в которой дисперсии компонент характеризуют их статистические свойства.

Учитывая, что объекты исследования в экономике характеризуются большим, но конечным количеством признаков, влияние которых подвергается воздействию большого количества случайных причин.

Вычисление главных компонент

Первой главной компонентой Z1 исследуемой системы признаков Х1, Х2, Х3 , Х4 ,…, Хn называется такая центрировано - нормированная линейная комбинация этих признаков, которая среди прочих центрировано - нормированных линейных комбинаций этих признаков, имеет дисперсию наиболее изменчивую.

В качестве второй главной компоненты Z2 мы будем брать такую центрировано - нормированную комбинацию этих признаков, которая:

не коррелированна с первой главной компонентой,

не коррелированны с первой главной компонентой, эта комбинация имеет наибольшую дисперсию.

K-ой главной компонентой Zk (k=1…m) мы будем называть такую центрировано - нормированную комбинацию признаков, которая:

не коррелированна с к-1 предыдущими главными компонентами,

среди всех возможных комбинаций исходных признаков, которые не

не коррелированны с к-1 предыдущими главными компонентами, эта комбинация имеет наибольшую дисперсию.

Введём ортогональную матрицу U и перейдём от переменных Х к переменным Z, причём

Вектор выбирается т. о., чтобы дисперсия была максимальной. После получения выбирается т. о., чтобы дисперсия была максимальной при условии, что не коррелированно с и т. д.

Так как признаки измерены в несопоставимых величинах, то удобнее будет перейти к центрированно-нормированным величинам. Матрицу исходных центрированно-нормированных значений признаков найдем из соотношения:

где - несмещенная, состоятельная и эффективная оценка математического ожидания,

Несмещенная, состоятельная и эффективная оценка дисперсии.

Матрица наблюденных значений исходных признаков приведена в Приложении.

Центрирование и нормирование произведено с помощью программы"Stadia".

Так как признаки центрированы и нормированы, то оценку корреляционной матрицы можно произвести по формуле:


Перед тем как проводить компонентный анализ, проведем анализ независимости исходных признаков.

Проверка значимости матрицы парных корреляций с помощью критерия Уилкса.

Выдвигаем гипотезу:

Н0: незначима

Н1: значима

125,7; (0,05;3,3) = 7,8

т.к > , то гипотеза Н0 отвергается и матрица является значимой, следовательно, имеет смысл проводить компонентный анализ.

Проверим гипотезу о диагональности ковариационной матрицы

Выдвигаем гипотезу:

Строим статистику, распределена по закону с степенями свободы.

123,21, (0,05;10) =18,307

т.к >, то гипотеза Н0 отвергается и имеет смысл проводить компонентный анализ.

Для построения матрицы факторных нагрузок необходимо найти собственные числа матрицы, решив уравнение.

Используем для этой операции функцию eigenvals системы MathCAD, которая возвращает собственные числа матрицы:

Т.к. исходные данные представляют собой выборку из генеральной совокупности, то мы получили не собственные числа и собственные вектора матрицы, а их оценки. Нас будет интересовать на сколько “хорошо” со статистической точки зрения выборочные характеристики описывают соответствующие параметры для генеральной совокупности.

Доверительный интервал для i-го собственного числа ищется по формуле:

Доверительные интервалы для собственных чисел в итоге принимают вид:

Оценка значения нескольких собственных чисел попадает в доверительный интервал других собственных чисел. Необходимо проверить гипотезу о кратности собственных чисел.

Проверка кратности производится с помощью статистики

где r-количество кратных корней.

Данная статистика в случае справедливости распределена по закону с числом степеней свободы. Выдвинем гипотезы:

Так как, то гипотеза отвергается, то есть собственные числа и не кратны.

Так как, то гипотеза отвергается, то есть собственные числа и не кратны.

Необходимо выделить главные компоненты на уровне информативности 0,85. Мера информативности показывает какую часть или какую долю дисперсии исходных признаков составляют k-первых главных компонент. Мерой информативности будем называть величину:

На заданном уровне информативности выделено три главных компоненты.

Запишем матрицу =

Для получения нормализованного вектора перехода от исходных признаков к главным компонентам необходимо решить систему уравнений: , где - соответствующее собственное число. После получения решения системы необходимо затем нормировать полученный вектор.

Для решения данной задачи воспользуемся функцией eigenvec системы MathCAD, которая возвращает нормированный вектор для соответствующего собственного числа.

В нашем случае первых четырех главных компонент достаточно для достижения заданного уровня информативности, поэтому матрица U (матрица перехода от исходного базиса к базису из собственных векторов)

Строим матрицу U, столбцами которой являются собственные вектора:

Матрица весовых коэффициентов:

Коэффициенты матрицы А являются коэффициентами корреляции между центрировано - нормированными исходными признаками и ненормированными главными компонентами, и показывают наличие, силу и направление линейной связи между соответствующими исходными признаками и соответствующими главными компонентами.

ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДА ГЛАВНЫХ КОМПОНЕНТ

ДЛЯ ОБРАБОТКИ МНОГОМЕРНЫХ СТАТИСТИЧЕСКИХ ДАННЫХ

Рассмотрены вопросы обработки многомерных статистических данных рейтинговой оценки студентов на основе применения метода главных компонент.

Ключевые слова: многомерный анализ данных, снижение размерности, метод главных компонент, рейтинг.

На практике часто приходится сталкиваться с ситуацией, когда объект исследования характеризуется множеством разнообразных параметров, каждый из которых измеряется или оценивается. Анализ полученного в результате исследования нескольких однотипных объектов массива исходных данных представляет собой практически нерешаемую задачу. Поэтому исследователю необходимо проанализировать связи и взаимозависимости между исходными параметрами, с тем чтобы отбросить часть из них или заменить их меньшим числом каких-либо функций от них, сохранив при этом по возможности всю заключенную в них информацию.

В связи с этим встают задачиснижения размерности, т. е. перехода от исходного массива данных к существенно меньшему количеству показателей, отобранных из числа исходных или полученных путем некоторого их преобразования (с наименьшей потерей информации, содержащейся в исходном массиве), и классификации – разделения рассматриваемой совокупности объектов на однородные (в некотором смысле) группы. Если по большому числу разнотипных и стохастически взаимосвязанных показателей были получены результаты статистического обследования целой совокупности объектов, то для решения задач классификации и снижения размерности следует использовать инструментарий многомерного статистического анализа, в частности метод главных компонент .


В статье предлагается методика применения метода главных компонент для обработки многомерных статистических данных. В качестве примера приводится решение задачи статистической обработки многомерных результатов рейтинговой оценки студентов.

1. Определение и вычисление главных компонент ..png" height="22 src="> признаков. В результате получаем многомерные наблюдения, каждое из которых можно представить в виде векторного наблюдения

где https://pandia.ru/text/79/206/images/image005.png" height="22 src=">.png" height="22 src=">– символ операции транспонирования.

Полученные многомерные наблюдения необходимо подвергнуть статистической обработке..png" height="22 src=">.png" height="22 src=">.png" width="132" height="25 src=">.png" width="33" height="22 src="> допустимых преобразований исследуемых признаков 0 " style="border-collapse:collapse">

– условие нормировки;

– условие ортогональности

Полученные подобным преобразованием https://pandia.ru/text/79/206/images/image018.png" width="79" height="23 src="> и представляют собой главные компоненты. Из нихпри дальнейшем анализеисключают переменные с минимальной дисперсией , т. е..png" width="131" height="22 src="> в преобразовании (2)..png" width="13" height="22 src="> этой матрицы равны дисперсиям главных компонент .

Таким образом, первой главной компонентой https://pandia.ru/text/79/206/images/image013.png" width="80" height="23 src=">называется такая нормированно-центрированная линейная комбинация этих показателей, которая среди всех прочих подобных комбинаций обладает наибольшей дисперсией..png" width="12" height="22 src=">собственный вектор матрицы https://pandia.ru/text/79/206/images/image025.png" width="15" height="22 src=">.png" width="80" height="23 src="> называется такая нормированно-центрированная линейная комбинация этих показателей, которая не коррелирована с https://pandia.ru/text/79/206/images/image013.png" width="80" height="23 src=">.png" width="80" height="23 src="> измеряются в различных единицах, то результаты исследования с помощью главных компонент будут существенно зависеть от выбора масштаба и природы единиц измерения , а полученные линейные комбинации исходных переменных будет трудно интерпретировать. В связи с этим при различных единицах измерения исходных признаков DIV_ADBLOCK310">


https://pandia.ru/text/79/206/images/image030.png" width="17" height="22 src=">.png" width="56" height="23 src=">. После подобного преобразования проводят анализ главных компонент относительно величин https://pandia.ru/text/79/206/images/image033.png" width="17" height="22 src=">, которая является одновременно корреляционной матрицей https://pandia.ru/text/79/206/images/image035.png" width="162" height="22 src=">.png" width="13" height="22 src="> на i - й исходный признак ..png" width="14" height="22 src=">.png" width="10" height="22 src="> равна дисперсии v - й главной компонентыhttps://pandia.ru/text/79/206/images/image038.png" width="10" height="22 src="> используются при содержательной интерпретации главных компонент..png" width="20" height="22 src=">.png" width="251" height="25 src=">

Для проведения расчетов векторные наблюдения агрегируем в выборочную матрицу, в которой строки соответствуют контролируемым признакам, а столбцы – объектам исследования (размерность матрицы – https://pandia.ru/text/79/206/images/image043.png" width="348" height="67 src=">

После центрирования исходных данных находим выборочную корреляционную матрицу по формуле

https://pandia.ru/text/79/206/images/image045.png" width="204" height="69 src=">

Диагональные элементы матрицы https://pandia.ru/text/79/206/images/image047.png" width="206" height="68 src=">

Недиагональные элементы этой матрицы представляют собой выборочные оценки коэффициентов корреляции между соответствующей парой признаков.

Составляем характеристическое уравнение для матрицы 0 " style="margin-left:5.4pt;border-collapse:collapse">

Находим все его корни:

Теперь для нахождения компонент главных векторов подставляем последовательно численные значения https://pandia.ru/text/79/206/images/image065.png" width="16" height="22 src=">.png" width="102" height="24 src=">

Например, при https://pandia.ru/text/79/206/images/image069.png" width="262" height="70 src=">

Очевидно, что полученная система уравнений совместна ввиду однородности и неопределенна, т. е. имеет бесконечное множество решений. Для нахождения единственного интересующего нас решения воспользуемся следующими положениями:

1. Для корней системы может быть записано соотношение

https://pandia.ru/text/79/206/images/image071.png" width="20" height="23 src="> – алгебраическое дополнение j -го элемента любой i -й строки матрицы системы.

2. Наличие условия нормировки (2) обеспечивает единственность решения рассматриваемой системы уравнений..png" width="13" height="22 src=">, определяются однозначно, за исключением того, что все они могут одновременно изменить знак. Однако знаки компонентов собственных векторов не играют существенной роли, так как их смена не влияет на результат анализа. Они могут служить только для индикации противоположных тенденций на соответствующей главной компоненте .

Таким образом, получаем собственный вектор https://pandia.ru/text/79/206/images/image025.png" width="15" height="22 src=">:

https://pandia.ru/text/79/206/images/image024.png" width="12" height="22 src="> проверяем по равенству

https://pandia.ru/text/79/206/images/image076.png" width="503" height="22">

… … … … … … … … …

https://pandia.ru/text/79/206/images/image078.png" width="595" height="22 src=">

https://pandia.ru/text/79/206/images/image080.png" width="589" height="22 src=">

где https://pandia.ru/text/79/206/images/image082.png" width="16" height="22 src=">.png" width="23" height="22 src="> – стандартизированные значения соответствующих исходных признаков.

Составляем ортогональную матрицу линейного преобразования https://pandia.ru/text/79/206/images/image086.png" width="94" height="22 src=">

Так как в соответствии со свойствами главных компонент сумма дисперсий исходных признаков равна сумме дисперсий всех главных компонент, то с учетом того, что мы рассматривали нормированные исходные признаки, можно оценить, какую часть общей изменчивости исходных признаков объясняет каждая из главных компонент. Например, для первых двух главных компонент имеем:

Таким образом, в соответствии с критерием информативности, используемым для главных компонент, найденных по корреляционной матрице, семьпервых главных компонент объясняют 88,97% общей изменчивости пятнадцати исходных признаков.

Используя матрицу линейного преобразования https://pandia.ru/text/79/206/images/image038.png" width="10" height="22 src="> (для семи первых главных компонент):

https://pandia.ru/text/79/206/images/image090.png" width="16" height="22 src="> – число дипломов, полученных в конкурсе научных и дипломных работ ; https://pandia.ru/text/79/206/images/image092.png" width="16" height="22 src=">.png" width="22" height="22 src=">.png" width="22" height="22 src=">.png" width="22" height="22 src="> – награды и призовые места, занятые на региональных, областных и городских спортивных соревнованиях.

3..png" width="16" height="22 src=">(число грамот по результатам участия в конкурсах научных и дипломных работ).

4..png" width="22" height="22 src=">(награды и призовые места, занятые на вузовских соревнованиях).

6. Шестая главная компонента положительно коррелирована с показателем DIV_ADBLOCK311">

4. Третья главная компонента – активность студентов в учебном процессе.

5. Четвертая и шестая компоненты – прилежность студентов в течение весеннего и осеннего семестров соответственно.

6. Пятая главная компонента – степень участия в спортивных соревнованиях университета.

В дальнейшем для проведения всех необходимых расчетов при выделении главных компонент предлагается использовать специализированные статистические программные комплексы, например STATISTICA, что существенно облегчит процесс анализа.

Описанный в данной статье процесс выделения главных компонент на примере рейтинговой оценки студентов предлагается использовать для аттестации бакалавров и магистров.

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Прикладная статистика: Классификация и снижение размерности: справ. изд. / , ; под ред. . – М.: Финансы и статистика, 1989. – 607 с.

2. Справочник по прикладной статистике:в 2 т.: [пер. с англ.] / под ред. Э. Ллойда, У. Ледермана, . – М.:Финансы и статистика, 1990. – Т. 2. – 526 c.

3. Прикладная статистика. Основы эконометрики . В 2 т. Т.1. Теория вероятностей и прикладная статистика: учеб. для вузов / , B. C. Мхитарян. – 2-е изд., испр.– М: ЮНИТИ-ДАНА, 2001. – 656 с.

4. Афифи, А. Статистический анализ: подход с использованием ЭВМ: [пер. с англ.] / А. Афифи, С. Эйзен.– М.: Мир, 1982. – 488 с.

5. Дронов, статистический анализ: учеб. пособие / . – Барна3. – 213 с.

6. Андерсон, Т. Введение в многомерный статистический анализ / Т. Андерсон; пер. с англ. [и др.]; под ред. . – М.: Гос. изд-во физ.-мат. лит., 1963. – 500 с.

7. Лоули, Д. Факторный анализ как статистический метод / Д. Лоули, А. Максвелл; пер. с англ. . – М.: Мир, 1967. – 144 с.

8. Дубров, статистические методы: учебник / , . – М.: Финансы и статистика, 2003. – 352 с.

9. Кендалл, М. Многомерный статистический анализ и временные ряды / М. Кендалл, А. Стьюарт;пер. с англ. , ; под ред. , . – М.: Наука,1976. – 736 с.

10. Белоглазов, анализ в задачах квалиметрии образования / // Изв. РАН. Теория и системы управления. – 2006. – №6. – С. 39 – 52.

Материал поступил в редколлегию 8.11.11.

Работа выполнена в рамках реализации федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009 – 2013 гг. (государственный контракт № П770).

Главные компоненты

5.1 Методы множественной регрессии и канонической корреляции предполагают разбиение имеющегося набора признаков на две части. Однако, далеко не всегда такое разбиение может быть объективно хорошо обоснованным, в связи с чем возникает необходимость в таких подходах к анализу взаимосвязей показателей, которые предполагали бы рассмотрение вектора признаков как единого целого. Разумеется, при реализации подобных подходов в этой батарее признаков может быть обнаружена определенная неоднородность, когда объективно выявятся несколько групп переменных. Для признаков из одной такой группы взаимные корреляции будут гораздо выше по сравнению с сочетаниями показателей из разных групп. Однако, эта группировка будет опираться на результаты объективного анализа данных, а - не на априорные произвольные соображения исследователя.

5.2 При изучении корреляционных связей внутри некоторого единого набора m признаков


X "= X 1 X 2 X 3 ... X m

можно воспользоваться тем же самым способом, который применялся в множественном регрессионном анализе и методе канонических корреляций - получением новых переменных, вариация которых полно отражает существование многомерных корреляций.

Целью рассмотрения внутригрупповых связей единого набора признаков является определение и наглядное представление объективно существующих основных направлений соотносительной вариации этих переменных. Поэтому, для этих целей можно ввести некие новые переменные Y i , находимые как линейные комбинации исходного набора признаков X

Y 1 = b 1 "X = b 11 X 1 + b 12 X 2 + b 13 X 3 + ... + b 1m X m

Y 2 = b 2 "X = b 21 X 1 + b 22 X 2 + b 23 X 3 + ... + b 2m X m

Y 3 = b 3 "X = b 31 X 1 + b 32 X 2 + b 33 X 3 + ... + b 3m X m (5.1)

... ... ... ... ... ... ...

Y m = b m "X = b m1 X 1 + b m2 X 2 + b m3 X 3 + ... + b m m X m

и обладающие рядом желательных свойств. Пусть для определенности число новых признаков равно числу исходных показателей (m).

Одним из таких желательных оптимальных свойств может быть взаимная некор-релированность новых переменных, то есть диагональный вид их ковариационной матрицы

S y1 2 0 0 ... 0

0 s y2 2 0 ... 0

S y = 0 0 s y3 2 ... 0 , (5.2)

... ... ... ... ...

0 0 0 … s ym 2

где s yi 2 - дисперсия i-го нового признака Y i . Некоррелированность новых переменных кроме своего очевидного удобства имеет важное свойство - каждый новый признак Y i будет учитывать только свою независимую часть информации об изменчивости и коррелированности исходных показателей X.

Вторым необходимым свойством новых признаков является упорядоченный учет вариации исходных показателей. Так, пусть первая новая переменная Y 1 будет учитывать максимальную долю суммарной вариации признаков X. Это, как мы позже увидим, равносильно требованию того, чтобы Y 1 имела бы максимально возможную дисперсию s y1 2 . С учетом равенства (1.17) это условие может быть записано в виде

s y1 2 = b 1 "Sb 1 = max , (5.3)

где S - ковариационная матрица исходных признаков X, b 1 - вектор, включающий коэффициенты b 11 , b 12 , b 13 , ..., b 1m при помощи которых, по значениям X 1 , X 2 , X 3 , ..., X m можно получить значение Y 1 .

Пусть вторая новая переменная Y 2 описывает максимальную часть того компонента суммарной вариации, который остался после учета наибольшей его доли в изменчивости первого нового признака Y 1 . Для достижения этого необходимо выполнение условия

s y2 2 = b 2 "Sb 2 = max , (5.4)

при нулевой связи Y 1 с Y 2 , (т.е. r y1y2 = 0) и при s y1 2 > s y2 2 .

Аналогичным образом, третий новый признак Y 3 должен описывать третью по степени важности часть вариации исходных признаков, для чего его дисперсия должна быть также максимальной

s y3 2 = b 3 "Sb 3 = max , (5.5)

при условиях, что Y 3 нескоррелирован с первыми двумя новыми признаками Y 1 и Y 2 (т.е. r y1y3 = 0, r y2y3 = 0) и s y1 2 > s y2 > s y3 2 .

Таким образом, для дисперсий всех новых переменных характерна упорядоченность по величине

s y1 2 > s y2 2 > s y3 2 > ... > s y m 2 . (5.6)

5.3 Векторы из формулы (5.1) b 1 , b 2 , b 3 , ..., b m , при помощи которых должен осу-ществляться переход к новым переменным Y i , могут быть записаны в виде матрицы


B = b 1 b 2 b 3 ... b m . (5.7)

Переход от набора исходных признаков X к набору новых переменных Y может быть представлен в виде матричной формулы

Y = B" X , (5.8)

а получение ковариационной матрицы новых признаков и достижение условия (5.2) некоррелированности новых переменных в соответствии с формулой (1.19) может быть представлено в виде

B"SB = S y , (5.9)

где ковариационная матрица новых переменных S y в силу их некоррелированности имеет диагональную форму. Из теории матриц (раздел А.25 Приложения А) известно, что, полу-чив для некоторой симметрической матрицы A собственные векторы u i и числа l i и обра-

зовав из них матрицы U и L , можно в соответствии с формулой (А.31) получить результат

U"AU = L ,

где L - диагональная матрица, включающая собственные числа симметрической матрицы A . Нетрудно видеть, что последнее равенство полностью совпадает с формулой (5.9). Поэтому, можно сделать следующий вывод. Желательные свойства новых переменных Y можно обеспечить, если векторы b 1 , b 2 , b 3 , ..., b m , при помощи которых должен осуществляться переход к этим переменным, будут собственными векторами ковариационной матрицы исходных признаков S . Тогда дисперсии новых признаков s yi 2 окажутся собственными числами

s y1 2 = l 1 , s y2 2 = l 2 , s y3 2 = l 3 , ... , s ym 2 = l m (5.10)

Новые переменные, переход к которым по формулам (5.1) и (5.8) осуществляется при помощи собственных векторов ковариационной матрицы исходных признаков, называются главными компонентами. В связи с тем, что число собственных векторов ковариационной матрицы в общем случае равно m - числу исходных признаков для этой матрицы, количество главных компонент также равно m.

В соответствии с теорией матриц для нахождения собственных чисел и векторов ковариационной матрицы следует решить уравнение

(S - l i I )b i = 0 . (5.11)

Это уравнение имеет решение, если выполняется условие равенства нулю определителя

½S - l i I ½ = 0 . (5.12)

Это условие по существу также оказывается уравнением, корнями которого являются все собственные числа l 1 , l 2 , l 3 , ..., l m ковариационной матрицы одновременно совпадающие с дисперсиями главных компонент. После получения этих чисел, для каждого i-го из них по уравнению (5.11) можно получить соответствующий собственный вектор b i . На практике для вычисления собственных чисел и векторов используются специальные итерационные процедуры (Приложение В).

Все собственные векторы можно записать в виде матрицы B , которая будет ортонормированной матрицей, так что (раздел А.24 Приложения А) для нее выполняется

B"B = BB" = I . (5.13)

Последнее означает, что для любой пары собственных векторов справедливо b i "b j = 0, а для любого такого вектора соблюдается равенство b i "b i = 1.

5.4 Проиллюстрируем получение главных компонент для простейшего случая двух исходных признаков X 1 и X 2 . Ковариационная матрица для этого набора равна

где s 1 и s 2 - средние квадратические отклонения признаков X 1 и X 2 , а r - коэффициент корреляции между ними. Тогда условие (5.12) можно записать в виде

S 1 2 - l i rs 1 s 2

rs 1 s 2 s 2 2 - l i

Рисунок 5.1 .Геометрический смысл главных компонент

Раскрывая определитель, можно получить уравнение

l 2 - l(s 1 2 + s 2 2) + s 1 2 s 2 2 (1 - r 2) = 0 ,

решая которое, можно получить два корня l 1 и l 2 . Уравнение (5.11) может быть также записано в виде


s 1 2 - l i r s 1 s 2 b i1 = 0

r s 1 s 2 s 2 2 - l i b i2 0

Подставляя в это уравнение l 1 , получим линейную систему

(s 1 2 - l 1) b 11 + rs 1 s 2 b 12 = 0

rs 1 s 2 b 11 + (s 2 2 - l 1)b 12 = 0 ,

решением которой являются элементы первого собственного вектора b 11 и b 12 . После аналогичной подстановки второго корня l 2 найдем элементы второго собственного вектора b 21 и b 22 .

5.5 Выясним геометрический смысл главных компонент. Наглядно это можно сделать лишь для простейшего случая двух признаков X 1 и X 2 . Пусть для них характерно двумерное нормальное распределение с положительным значением коэффициента корреляции. Если все индивидуальные наблюдения нанести на плоскость, образованную осями признаков, то соответствующие им точки расположатся внутри некоторого корреляционного эллипса (рис.5.1). Новые признаки Y 1 и Y 2 также могут быть изображены на этой же плоскости в виде новых осей. По смыслу метода для первой главной компоненты Y 1 , учитывающей максимально возможную суммарную дисперсию признаков X 1 и X 2 , должен достигаться максимум ее дисперсии. Это означает, что для Y 1 следует найти та-

кую ось, чтобы ширина распределения ее значений была бы наибольшей. Очевидно, что это будет достигаться, если эта ось совпадет по направлению с наибольшей осью корреляционного эллипса. Действительно, если мы спроецируем все соответствующие индивидуальным наблюдениям точки на эту координату, то получим нормальное распределение с максимально возможным размахом и наибольшей дисперсией. Это будет распределение индивидуальных значений первой главной компоненты Y 1 .

Ось, соответствующая второй главной компоненте Y 2 , должна быть проведена перпендикулярно к первой оси, так как это следует из условия некоррелированности главных компонент. Действительно, в этом случае мы получим новую систему координат с осями Y 1 и Y 2 , совпадающими по направлению с осями корреляционного эллипса. Можно видеть, что корреляционный эллипс при его рассмотрении в новой системе координат демонстрирует некоррелированность индивидуальных значений Y 1 и Y 2 , тогда как для величин исходных признаков X 1 и X 2 корреляция наблюдалась.

Переход от осей, связанных с исходными признаками X 1 и X 2 , к новой системе координат, ориентированной на главные компоненты Y 1 и Y 2 , равносилен повороту старых осей на некоторый угол j. Его величина может быть найдена по формуле

Tg 2j = . (5.14)

Переход от значений признаков X 1 и X 2 к главным компонентам может быть осуществлен в соответствии с результатами аналитической геометрии в виде

Y 1 = X 1 cos j + X 2 sin j

Y 2 = - X 1 sin j + X 2 cos j .

Этот же результат можно записать в матричном виде

Y 1 = cos j sin j X 1 и Y 2 = -sin j cos j X 1 ,

который точно соответствует преобразованию Y 1 = b 1 "X и Y 2 = b 2 "X . Иными словами,

= B" . (5.15)

Таким образом, матрица собственных векторов может также трактоваться как включающая тригонометрические функции угла поворота, который следует осуществить для перехода от системы координат, связанной с исходными признаками, к новым осям, опирающимся на главные компоненты.

Если мы имеем m исходных признаков X 1 , X 2 , X 3 , ..., X m , то наблюдения, состав-ляющие рассматриваемую выборку, расположатся внутри некоторого m-мерного корреляционного эллипсоида. Тогда ось первой главной компоненты совпадет по направлению с наибольшей осью этого эллипсоида, ось второй главной компоненты - со второй осью этого эллипсоида и т.д. Переход от первоначальной системы координат, связанной с осями признаков X 1 , X 2 , X 3 , ..., X m к новым осям главных компонент окажется равносильным осуществлению нескольких поворотов старых осей на углы j 1 , j 2 , j 3 , ..., а матрица перехода B от набора X к системе главных компонент Y , состоящая из собственных век-

торов ковариационной матрицы, включает в себя тригонометрические функции углов новых координатных осей со старыми осями исходных признаков.

5.6 В соответствии со свойствами собственных чисел и векторов следы ковариа-ционных матриц исходных признаков и главных компонент - равны. Иными словами

tr S = tr S y = tr L (5.16)

s 11 + s 22 + ... + s mm = l 1 + l 2 + ... + l m ,

т.е. сумма собственных чисел ковариационной матрицы равна сумме дисперсий всех исходных признаков. Поэтому, можно говорить о некоторой суммарной величине дисперсии исходных признаков равной tr S , и учитываемой системой собственных чисел.

То обстоятельство, что первая главная компонента имеет максимальную дисперсию, равную l 1 , автоматически означает, что она описывает и максимальную долю суммарной вариации исходных признаков tr S . Аналогично, вторая главная компонента имеет вторую по величине дисперсию l 2 , что соответствует второй по величине учитываемой доле суммарной вариации исходных признаков и т.д.

Для каждой главной компоненты можно определить долю суммарной величины изменчивости исходных признаков, которую она описывает

5.7 Очевидно, представление о суммарной вариации набора исходных признаков X 1 , X 2 , X 3 , ..., X m , измеряемой величиной tr S , имеет смысл только в том случае, когда все эти признаки измерены в одинаковых единицах. В противном случае придется складывать дисперсии, разных признаков, одни из которых будут выражены в квадратах миллиметров, другие - в квадратах килограммов, третьи – в квадратах радиан или градусов и т.д. Этого затруднения легко избежать, если от именованных значений признаков X ij перейти к их нормированным величинам z ij = (X ij - M i)./ S i где M i и S i - средняя арифметическая величина и среднее квадратическое отклонение i-го признака. Нормированные признаки z имеют нулевые средние, единичные дисперсии и не связаны с какими-либо единицами измерения. Ковариационная матрица исходных признаков S превратится в корреляционную матрицу R .

Все сказанное о главных компонентах, находимых для ковариационной матрицы, остается справедливым и для матрицы R . Здесь точно также можно, опираясь на собственные векторы корреляционной матрицы b 1 , b 2 , b 3 , ..., b m , перейти от исходных признаков z i к главным компонентам y 1 , y 2 , y 3 , ..., y m

y 1 = b 1 "z

y 2 = b 2 "z

y 3 = b 3 "z

y m = b m "z .

Это преобразование можно также записать в компактном виде

y = B"z ,

Рисунок 5.2 . Геометрический смысл главных компонент для двух нормированных признаков z 1 и z 2

где y - вектор значений главных компонент, B - матрица, включающая собственные векторы, z - вектор исходных нормированных признаков. Справедливым оказывается и равенство

B"RB = ... ... … , (5.18)

где l 1 , l 2 , l 3 , ..., l m - собственные числа корреляционной матрицы.

Результаты, получающиеся при анализе корреляционной матрицы, отличаются от аналогичных результатов для матрицы ковариационной. Во-первых, теперь можно рассматривать признаки, измеренные в разных единицах. Во-вторых, собственные векторы и числа, найденные для матриц R и S , также различны. В-третьих, главные компоненты, определенные по корреляционной матрице и опирающиеся на нормированные значения признаков z, оказываются центрироваными - т.е. имеющими нулевые средние величины.

К сожалению, определив собственные векторы и числа для корреляционной матрицы, перейти от них к аналогичным векторами и числам ковариационной матрицы - невозможно. На практике обычно используются главные компоненты, опирающиеся на корреляционную матрицу, как более универсальные.

5.8 Рассмотрим геометрический смысл главных компонент, определенных по корреляционной матрице. Наглядным здесь оказывается случай двух признаков z 1 и z 2 . Система координат, связанная с этими нормированными признаками, имеет нулевую точку, размещенную в центре графика (рис.5.2). Центральная точка корреляционного эллипса,

включающего все индивидуальные наблюдения, совпадет с центром системы координат. Очевидно, что ось первой главной компоненты, имеющая максимальную вариацию, совпадет с наибольшей осью корреляционного эллипса, а координата второй главной компоненты будет сориентирована по второй оси этого эллипса.

Переход от системы координат, связанной с исходными признаками z 1 и z 2 к новым осям главных компонент равносилен повороту первых осей на некоторый угол j. Дисперсии нормированных признаков равны 1 и по формуле (5.14) можно найти величину угла поворота j равную 45 o . Тогда матрица собственных векторов, которую можно определить через тригонометрические функции этого угла по формуле (5.15), будет равна

Cos j sin j 1 1 1

B " = = .

Sin j cos j (2) 1/2 -1 1

Значения собственных чисел для двумерного случая также несложно найти. Условие (5.12) окажется вида

что соответствует уравнению

l 2 - 2l + 1 - r 2 = 0 ,

которое имеет два корня

l 1 = 1 + r (5.19)

Таким образом, главные компоненты корреляционной матрицы для двух нормированных признаков могут быть найдены по очень простым формулам

Y 1 = (z 1 + z 2) (5.20)

Y 2 = (z 1 - z 2)

Их средние арифметические величины равны нулю, а средние квадратические отклонения имеют значения

s y1 = (l 1) 1/2 = (1 + r) 1/2

s y2 = (l 2) 1/2 = (1 - r) 1/2

5.9 В соответствии со свойствами собственных чисел и векторов следы корреляционной матрицы исходных признаков и матрицы собственных чисел - равны. Суммарная вариация m нормированных признаков равна m. Иными словами

tr R = m = tr L (5.21)

l 1 + l 2 + l 3 + ... + l m = m .

Тогда доля суммарной вариации исходных признаков, описываемая i-ой главной компонентой равна

Можно также ввести понятие P cn - доли суммарной вариации исходных признаков, описываемой первыми n главными компонентами,

n l 1 + l 2 + ... + l n

P cn = S P i = . (5.23)

То обстоятельство, что для собственных чисел наблюдается упорядоченность вида l 1 > l 2 > > l 3 > ... > l m , означает, что аналогичные соотношения будут свойственны и долям, описываемой главными компонентами вариации

P 1 > P 2 > P 3 > ... > P m . (5.24)

Свойство (5.24) влечет за собой специфический вид зависимости накопленной доли P сn от n (рис.5.3). В данном случае первые три главные компоненты описывают основную часть изменчивости признаков. Это означает, что часто немногие первые главные компоненты могут совместно учитывать до 80 - 90% суммарной вариации признаков, тогда как каждая последующая главная компонента будет увеличивать эту долю весьма незначительно. Тогда для дальнейшего рассмотрения и интерпретации можно использовать только эти немногие первые главные компоненты с уверенностью, что именно они описывают наиболее важные закономерности внутригрупповой изменчивости и коррелированности

Рисунок 5.3. Зависимость доли суммарной вариации признаков P cn , описываемой n первыми главными компонентами, от величины n. Число признаков m = 9

Рисунок 5.4. К определению конструкции критерия отсеивания главных компонент

признаков. Благодаря этому, число информативных новых переменных, с которыми следует работать, может быть уменьшено в 2 - 3 раза. Таким образом, главные компоненты имеют еще одно важное и полезное свойство - они значительно упрощают описание вариации исходных признаков и делают его более компактным. Такое уменьшение числа переменных всегда желательно, но оно связано с некоторыми искажениями взаимного расположения точек, соответствующих отдельным наблюдениям, в пространстве немногих первых главных компонент по сравнению с m-мерным пространством исходных признаков. Эти искажения возникают из-за попытки втиснуть пространство признаков в пространство первых главных компонент. Однако, в математической статистике доказывается, что из всех методов, позволяющих значительно уменьшить число переменных, переход к главным компонентам приводит к наименьшим искажениям структуры наблюдений связанных с этим уменьшением.

5.10 Важным вопросом анализа главных компонент является проблема определения их количества для дальнейшего рассмотрения. Очевидно, что увеличение числа главных компонент повышает накопленную долю учитываемой изменчивости P cn и приближает ее к 1. Одновременно, компактность получаемого описания уменьшается. Выбор того количества главных компонент, которое одновременно обеспечивает и полноту и компактность описания может базироваться на разных критериях, применяемых на практике. Перечислим наиболее распространенные из них.

Первый критерий основан на том соображении, что количество учитываемых главных компонент должно обеспечивать достаточную информативную полноту описания. Иными словами, рассматриваемые главные компоненты должны описывать большую часть суммарной изменчивости исходных признаков: до 75 - 90%. Выбор конкретного уровня накопленной доли P cn остается субъективным и зависящим как от мнения исследователя, так и от решаемой задачи.

Другой аналогичный критерий (критерий Кайзера) позволяет включать в рассмотрение главные компоненты с собственными числами большими 1. Он основан на том соображении, что 1 - это дисперсия одного нормированного исходного признака. Поэто-

му, включение в дальнейшее рассмотрение всех главных компонент с собственными числами большими 1 означает что мы рассматриваем только те новые переменные, которые имеют дисперсии не меньше чем у одного исходного признака. Критерий Кайзера весьма распространен и его использование заложено во многие пакеты программ статистической обработки данных, когда требуется задать минимальную величину учитываемого собственного числа, и по умолчанию часто принимается значение равное 1.

Несколько лучше теоретически обоснован критерий отсеивания Кеттела. Его применение основано на рассмотрении графика, на котором нанесены значения всех собственных чисел в порядке их убывания (рис.5.4). Критерий Кеттела основан на том эффекте, что нанесенная на график последовательность величин полученных собственных чисел обычно дает вогнутую линию. Несколько первых собственных чисел обнаруживают непрямолинейное уменьшение своего уровня. Однако, начиная с некоторого собственного числа, уменьшение этого уровня становится примерно прямолинейным и довольно пологим. Включение главных компонент в рассмотрение завершается той из них, собственное число которой начинает прямолинейный пологий участок графика. Так, на рисунке 5.4 в соответствие с критерием Кеттела в рассмотрение следует включить только первые три главные компоненты, потому что третье собственное число находится в самом начале прямолинейного пологого участка графика.

Критерий Кеттела основан на следующем. Если рассматривать данные по m признакам, искусственно полученные из таблицы нормально распределенных случайных чисел, то для них корреляции между признаками будут носить совершенно случайный характер и будут близкими к 0. При нахождении здесь главных компонент можно будет обнаружить постепенное уменьшение величины их собственных чисел, имеющее прямолинейной характер. Иными словами, прямолинейное уменьшение собственных чисел может свидетельствовать об отсутствии в соответствующей им информации о коррелированности признаков неслучайных связей.

5.11 При интерпретации главных компонент чаще всего используются собственные векторы, представленные в виде так называемых нагрузок - коэффициентов корреляции исходных признаков с главными компонентами. Собственные векторы b i , удовлетворяющие равенству (5.18), получаются в нормированном виде, так что b i "b i = 1. Это означает, что сумма квадратов элементов каждого собственного вектора равна 1. Собственные векторы, элементы которых являются нагрузками, могут быть легко найдены по формуле

a i = (l i) 1/2 b i . (5.25)

Иными словами, домножением нормированной формы собственного вектора на корень квадратный его собственного числа, можно получить набор нагрузок исходных признаков на соответствующую главную компоненту. Для векторов нагрузок справедливым оказывается равенство a i "a i = l i , означающее, что сумма квадратов нагрузок на i-ю главную компоненту равна i-му собственному числу. Компьютерные программы обычно выводят собственные векторы именно в виде нагрузок. При необходимости получения этих векторов в нормированном виде b i это можно сделать по простой формуле b i = a i / (l i) 1/2 .

5.12 Математические свойства собственных чисел и векторов таковы, что в соответствии с разделом А.25 Приложения А исходная корреляционная матрица R может быть представлена в виде R = BLB" , что также можно записать как

R = l 1 b 1 b 1 " + l 2 b 2 b 2 " + l 3 b 3 b 3 " + ... + l m b m b m " . (5.26)

Следует заметить, что любой из членов l i b i b i " , соответствующий i-й главной компоненте, является квадратной матрицей

L i b i1 2 l i b i1 b i2 l i b i1 b i3 … l i b i1 b im

l i b i b i " = l i b i1 b i2 l i b i2 2 l i b i2 b i3 ... l i b i2 b im . (5.27)

... ... ... ... ...

l i b i1 b im l i b i2 b im l i b i3 b im ... l i b im 2

Здесь b ij - элемент i-го собственного вектора у j-го исходного признака. Любой диагональный член такой матрицы l i b ij 2 есть некоторая доля вариации j-го признака, описываемая i-й главной компонентой. Тогда дисперсия любого j-го признака может быть представлена в виде

1 = l 1 b 1j 2 + l 2 b 2j 2 + l 3 b 3j 2 + ... + l m b mj 2 , (5.28)

означающем ее разложение по вкладам, зависящим от всех главных компонент.

Аналогично, любой внедиагональный член l i b ij b ik матрицы (5.27) является некоторой частью коэффициента корреляции r jk j-го и k-го признаков, учитываемой i-й главной компонентой. Тогда можно выписать разложение этого коэффициента в виде суммы

r jk = l 1 b 1j b 1k + l 2 b 2j b 2k + ... + l m b mj b mk , (5.29)

вкладов в него всех m главных компонент.

Таким образом, из формул (5.28) и (5.29) можно наглядно видеть, что каждая главная компонента описывает определенную часть дисперсии каждого исходного признака и коэффициента корреляции каждого их сочетания.

С учетом, того, что элементы нормированной формы собственных векторов b ij связаны с нагрузками a ij простым соотношением (5.25), разложение (5.26) может быть выписано и через собственные векторы нагрузок R = AA" , что также можно представить как

R = a 1 a 1 " + a 2 a 2 " + a 3 a 3 " + ... + a m a m " , (5.30)

т.е. как сумму вкладов каждой из m главных компонент. Каждый из этих вкладов a i a i " можно записать в виде матрицы

A i1 2 a i1 a i2 a i1 a i3 ... a i1 a im

a i1 a i2 a i2 2 a i2 a i3 ... a i2 a im

a i a i " = a i1 a i3 a i2 a i3 a i3 2 ... a i3 a im , (5.31)

... ... ... ... ...

a i1 a im a i2 a im a i3 a im ... a im 2

на диагоналях которой размещены a ij 2 - вклады в дисперсию j-го исходного признака, а внедиагональные элементы a ij a ik - есть аналогичные вклады в коэффициент корреляции r jk j-го и k-го признаков.

Метод главных компонент или компонентный анализ (principal component analysis, PCA) - один из важнейших методов в арсенале зоолога или эколога. К сожалению, в тех случаях, когда вполне уместным является применение компонентного анализа, сплошь и рядом применяют кластерный анализ.

Типичная задача, для которой полезен компонентный анализ, такова: есть некое множество объектов, каждый из которых охарактеризован по определенному (достаточно большому) количеству признаков. Исследователя интересуют закономерности, отраженные в разнообразии этих объектов. В том случае, когда есть основания предполагать, что объекты распределены по иерархически соподчиненным группам, можно использовать кластерный анализ - метод классификации (распределения по группам). Если нет оснований ожидать, что в разнообразии объектов отражена какая-то иерархия, логично использовать ординацию (упорядоченное расположение). Если каждый объект охарактеризован по достаточно большому количеству признаков (по крайней мере - такому количеству признаков, какое не получается адекватно отразить на одном графике), оптимально начинать исследование данных с анализа главных компонент. Дело в том, что этот метод является одновременно методом понижения размерности (количества измерений) данных.

Если группа рассматриваемых объектов охарактеризована значениями одного признака, для характеристики их разнообразия можно использовать гистограмму (для непрерывных признаков) или столбчатую диаграмму (для характеристики частот дискретного признака). Если объекты охарактеризованы двумя признаками, можно использовать двумерный график рассеяния, если тремя - трехмерный. А если признаков много? Можно попытаться на двумерном графике отразить взаимное расположение объектов друг относительно друга в многомерном пространстве. Обычно такое понижение размерности связано с потерей информации. Из разных возможных способов такого отображения надо выбрать тот, при котором потеря информации будет минимальной.

Поясним сказанное на самом простом примере: переходе от двумерного пространства к одномерному. Минимальное количество точек, которое задает двумерное пространство (плоскость) - 3. На рис. 9.1.1 показано расположение трех точек на плоскости. Координаты этих точек легко читаются по самому рисунку. Как выбрать прямую, которая будет нести максимальную информацию о взаиморасположении точек?

Рис. 9.1.1. Три точки на плоскости, заданной двумя признаками. На какую прямую будет проецироваться максимальная дисперсия этих точек?

Рассмотрим проекции точек на прямую A (показанную синим цветом). Координаты проекций этих точек на прямую A таковы: 2, 8, 10. Среднее значение - 6 2 / 3 . Дисперсия (2-6 2 / 3)+ (8-6 2 / 3)+ (10-6 2 / 3)=34 2 / 3 .

Теперь рассмотрим прямую B (показанную зеленым цветом). Координаты точек - 2, 3, 7; среднее значение - 4, дисперсия - 14. Таким образом, на прямую B отражается меньшая доля дисперсии, чем на прямую A.

Какова эта доля? Поскольку прямые A и B ортогональны (перпендикулярны), доли общей дисперсии, проецирующиеся на A и B, не пересекаются. Значит, общую дисперсию расположения интересующих нас точек можно вычислить как сумму этих двух слагаемых: 34 2 / 3 +14=48 2 / 3 . При этом на прямую A проецируется 71,2% общей дисперсии, а на прямую B - 28,8%.

А как определить, на какую прямую отразится максимальная доля дисперсии? Эта прямая будет соответствовать линии регрессии для интересующих нас точек, которая обозначена как C (красный цвет). На эту прямую отразится 77,2% общей дисперсии, и это - максимально возможное значение при данном расположении точек. Такую прямую, на которую проецируется максимальная доля общей дисперсии, называют первой главной компонентой .

А на какую прямую отразить оставшиеся 22,8% общей дисперсии? На прямую, перпендикулярную первой главной компоненте. Эта прямая тоже будет являться главной компонентой, ведь на нее отразится максимально возможная доля дисперсии (естественно, без учета той, которая отразилась на первую главную компоненту). Таким образом, это - вторая главная компонента .

Вычислив эти главные компоненты с помощью Statistica (диалог мы опишем чуть позже), мы получим картину, показанную на рис. 9.1.2. Координаты точек на главных компонентах показываются в стандартных отклонениях.


Рис. 9.1.2. Расположение трех точек, показанных на рис. 9.1.1, на плоскости двух главных компонент. Почему эти точки располагаются друг относительно друга иначе, чем на рис. 9.1.1?

На рис. 9.1.2 взаиморасположение точек оказывается измененным. Чтобы в дальнейшем правильно интерпретировать подобные картинки, следует рассмотреть причины отличий в расположении точек на рис. 9.1.1 и 9.1.2 подробнее. Точка 1 в обоих случаях находится правее (имеет большую координату по первому признаку и первой главной компоненте), чем точка 2. Но, почему-то, точка 3 на исходном расположении находится ниже двух других точек (имеет наименьшее значение признака 2), и выше двух других точек на плоскости главных компонент (имеет большую координату по второй компоненте). Это связано с тем, что метод главных компонент оптимизирует именно дисперсию исходных данных, проецирующихся на выбираемые им оси. Если главная компонента коррелирована с какой-то исходной осью, компонента и ось могут быть направлены в одну сторону (иметь положительную корреляцию) или в противоположные стороны (иметь отрицательные корреляции). Оба эти варианта равнозначны. Алгоритм метода главных компонент может «перевернуть» или не «перевернуть» любую плоскость; никаких выводов на основании этого делать не следует.

Однако точки на рис. 9.1.2 не просто «перевернуты» по сравнению с их взаиморасположением на рис. 9.1.1; определенным образом изменилось и их взаиморасположения. Отличия между точками по второй главной компоненте кажутся усиленными. 22,76% общей дисперсии, приходящиеся на вторую компоненту, «раздвинули» точки на такую же дистанцию, как и 77,24% дисперсии, приходящихся на первую главную компоненту.

Чтобы расположение точек на плоскости главных компонент соответствовало их действительному расположению, эту плоскость следовало бы исказить. На рис. 9.1.3. показаны два концентрических круга; их радиусы соотносятся как доли дисперсий, отражаемых первой и второй главными компонентами. Картинка, соответствующая рис. 9.1.2, искажена так, чтобы среднеквадратичное отклонение по первой главной компоненте соответствовало большему кругу, а по второй - меньшему.


Рис. 9.1.3. Мы учли, что на первую главную компоненту приходится бо льшая доля дисперсии, чем на вторую. Для этого мы исказили рис. 9.1.2, подогнав его под два концентрических круга, радиусы которых соотносятся, как доли дисперсий, приходящихся на главные компоненты. Но расположение точек все равно не соответствует исходному, показанному на рис. 9.1.1!

А почему взаимное расположение точек на рис. 9.1.3 не соответствует таковому на рис. 9.1.1? На исходном рисунке, рис. 9.1 точки расположены в соответствии со своими координатами, а не в соответствии с долями дисперсии, приходящимися на каждую ось. Расстоянию в 1 единицу по первому признаку (по оси абсцисс) на рис. 9.1.1 приходятся меньшая доля дисперсии точек по этой оси, чем расстоянию в 1 единицу по второму признаку (по оси ординат). А на рис 9.1.1 расстояния между точками определяются именно теми единицами, в которых измеряются признаки, по которым они описаны.

Несколько усложним задачу. В табл. 9.1.1 показаны координаты 10 точек в 10-мерном пространстве. Первые три точки и первые два измерения - это тот пример, который мы только что рассматривали.

Таблица 9.1.1. Координаты точек для дальнейшего анализа

Координаты

В учебных целях вначале рассмотрим только часть данных из табл. 9.1.1. На рис. 9.1.4 мы видим положение десяти точек на плоскости первых двух признаков. Обратите внимание, что первая главная компонента (прямая C) прошла несколько иначе, чем в предыдущем случае. Ничего удивительного: на ее положение влияют все рассматриваемые точки.


Рис. 9.1.4. Мы увеличили количество точек. Первая главная компонента проходит уже несколько иначе, ведь на нее оказали влияние добавленные точки

На рис. 9.1.5 показано положение рассмотренных нами 10 точек на плоскости двух первых компонент. Обратите внимание: все изменилось, не только доля дисперсии, приходящейся на каждую главную компоненту, но даже положение первых трех точек!


Рис. 9.1.5. Ординация в плоскости первых главных компонент 10 точек, охарактеризованных в табл. 9.1.1. Рассматривались только значения двух первых признаков, последние 8 столбцов табл. 9.1.1 не использовались

В общем, это естественно: раз главные компоненты расположены иначе, то изменилось и взаиморасположение точек.

Трудности в сопоставлении расположения точек на плоскости главных компонент и на исходной плоскости значений их признаков могут вызвать недоумение: зачем использовать такой трудноинтерпретируемый метод? Ответ прост. В том случае, если сравниваемые объекты описаны всего по двум признакам, вполне можно использовать их ординацию по этим, исходным признакам. Все преимущества метода главных компонент проявляются в случае многомерных данных. Метод главных компонент в таком случае оказывается эффективным способом снижения размерности данных.

9.2. Переход к начальным данным с большим количеством измерений

Рассмотрим более сложный случай: проанализируем данные, представленные в табл. 9.1.1 по всем десяти признакам. На рис. 9.2.1 показано, как вызывается окно интересующего нас метода.


Рис. 9.2.1. Запуск метода главных компонент

Нас будет интересовать только выбор признаков для анализа, хотя диалог Statistica позмоляет намного более тонкую настройку (рис. 9.2.2).


Рис. 9.2.2. Выбор переменных для анализа

После выполнения анализа появляется окно его результатов с несколькими вкладками (рис. 9.2.3). Все основные окна доступны уже из первой вкладки.


Рис. 9.2.3. Первая вкладка диалога результатов анализа главных компонент

Можно увидеть, что анализ выделил 9 главных компонент, причем описал с их помощью 100% дисперсии, отраженной в 10 начальных признаках. Это означает, что один признак был лишним, избыточным.

Начнем просматривать результаты с кнопки «Plot case factor voordinates, 2D»: она покажет расположение точек на плоскости, заданной двумя главными компонентами. Нажав эту кнопку, мы попадем в диалог, где надо будет указать, какие мы будем использовать компоненты; естественно начинать анализ с первой и второй компонент. Результат - на рис. 9.2.4.


Рис. 9.2.4. Ординация рассматриваемых объектов на плоскости двух первых главных компонент

Положение точек изменилось, и это естественно: в анализ вовлечены новые признаки. На рис. 9.2.4 отражено более 65% всего разнообразия в положении точек друг относительно друга, и это уже нетривиальный результат. К примеру, вернувшись к табл. 9.1.1, можно убедиться в том, что точки 4 и 7, а также 8 и 10 действительно достаточно близки друг к другу. Впрочем, отличия между ними могут касаться других главных компонент, не показанных на рисунке: на них, все-таки, тоже приходится треть оставшейся изменчивости.

Кстати, при анализе размещения точек на плоскости главных компонент может возникнуть необходимость проанализировать расстояния между ними. Проще всего получить матрицу дистанций между точками с использованием модуля для кластерного анализа.

А как выделенные главные компоненты связаны с исходными признаками? Это можно узнать, нажав кнопку (рис. 9.2.3) Plot var. factor coordinates, 2D. Результат - на рис. 9.2.5.


Рис. 9.2.5. Проекции исходных признаков на плоскость двух первых главных компонент

Мы смотрим на плоскость двух главных компонент «сверху». Исходные признаки, которые никак не связаны с главными компонентами, будет перпендикулярны (или почти перпендикулярны) им и отразятся короткими отрезками, заканчивающимися вблизи начала координат. Так, меньше всего с двумя первыми главными компонентами связан признак № 6 (хотя он демонстрирует определенную положительную корреляцию с первой компонентой). Отрезки, соответствующие тем признакам, которые полностью отразятся на плоскости главных компонент, будут заканчиваться на охватывающей центр рисунка окружности единичного радиуса.

Например, можно увидеть, что на первую главную компоненту сильнее всего повлияли признаки 10 (связан положительной корреляцией), а также 7 и 8 (связаны отрицательной корреляцией). Чтобы рассмотреть структуру таких корреляций подробнее, можно нажать кнопку Factor coordinates of variables, и получить таблицу, показанную на рис. 9.2.6.


Рис. 9.2.6. Корреляции между исходными признаками и выделенными главными компонентами (Factors)

Кнопка Eigenvalues выводит величины, которые называются собственными значениями главных компонент . В верхней части окна, показанного на рис. 9.2.3, выведены такие значения для нескольких первых компонент; кнопка Scree plot показывает их в удобной для восприятия форме (рис. 9.2.7).


Рис. 9.2.7. Собственные значения выделенных главных компонент и доли отраженной ими общей дисперсии

Для начала надо понять, что именно показывает значение eigenvalue. Это - мера дисперсии, отразившейся на главную компоненту, измеренная в количестве дисперсии, приходившейся на каждый признак в начальных данных. Если eigenvalue первой главной компоненты равен 3,4, это означает, что на нее отражается больше дисперсии, чем на три признака из начального набора. Собственные величины линейно связаны с долей дисперсии, приходящейся на главную компоненту, единое что, сумма собственных значений равна количеству исходных признаков, а сумма долей дисперсии равна 100%.

А что означает, что информацию об изменчивости по 10 признакам удалось отразить в 9 главных компонентах? Что один из начальных признаков был избыточным, не добавлял никакой новой информации. Так и было; на рис. 9.2.8 показано, как был сгенерирован набор точек, отраженный в табл. 9.1.1.